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官宣|MG娱乐网站网址与清华大学颉伟团队在单细胞Hi-C领域深化合作

发布时间:2020-9-30 16:49:14阅读次数: 分享到:

    MG娱乐网站网址重磅引入清华大学颉伟团队sisHi-C(small scale in situ Hi-C)专利技术,深耕单细胞三维基因组测序技术领域,持续创新、引领行业。


    传统的Hi-C技术反应体系较大,离心、洗涤、换管步骤繁多,在DNA扩增前进行片段大小选择会造成大量的DNA损失。而且由于DNA片段大小选择范围较窄,远远超过超声波打断对DNA片段的富集程度,导致用于二代测序的DNA量进一步缩减。以上几个因素,使得Hi-C技术通常用于研究数量级在10⁷以上的常见类型细胞,而对于处于胚胎发育早期数量级在10³以下的这类细胞其研究受到了极大的技术限制。剖析传统技术的不足,sisHi-C技术通过对缩小反应体系、更改细胞转移方式、改变DNA片段大小选择的范围和时间等方面进行创造性地优化,提出了更为优良的全基因组DNA测序文库构建方法,可以对细胞数目低至10个的珍贵细胞类型进行研究,为探索胚胎早期发育的基因组三维结构建立模式和基因表达调控机制带来了希望。与传统的Hi-C技术相比,sisHi-C在PCR扩增前的DNA含量与测序有效数据比例方面,均有极显著的提升。

    在低细胞量Hi-C的研究上,mg注册就送58从未停止前进的步伐,在2019年6月,成功实现了低至500个细胞量的Hi-C建库测序,且达到59%的有效数据率,详见《突破!MG娱乐网站网址低细胞量Hi-C强势来袭!》。

    在2019年7月,mg注册就送58再接再厉,将Hi-C建库起始量陡降至200个细胞,且有效数据率接近50%,详见《再次突破!MG娱乐网站网址低起始量Hi-C建库降至200个细胞!》。


    本次与清华大学进行sisHi-C技术合作,将进一步巩固mg注册就送58单细胞三维基因组测序技术的领先地位。在成功实现低至200个细胞的Hi-C建库后,结合sisHi-C的技术优化,MG娱乐网站网址计划进一步将细胞量降低至10~100个细胞,实现百个细胞数以内的Hi-C建库测序


    MG娱乐网站网址专注于三维基因组学技术,业务范围涵盖3C、4C、Hi-C、ATAC-seq、HiChIP、Capture Hi-C、CUT&Tag等技术,多年来不断推进三维基因组学新技术开发,该技术的合作将有效扩大公司三维基因组的应用,整合积累的三维基因组学研究经验,继续发挥MG娱乐网站网址在三维基因组学研究领域的技术优势,为广大科研工作者提供更优质的服务。


颉伟教授团队介绍

    清华大学生命科学学院颉伟教授课题组结合实验生物学和生物信息学的手段,长期致力于干细胞与胚胎早期发育及命运决定过程中的表观遗传调控机理研究。主要研究方向包括:

    1.干细胞分化过程中的组蛋白修饰和DNA甲基化介导的表观遗传调控;

    2.动物胚胎早期发育过程中的表观遗传调控;

    3.Cis-regulatory elements如启动子和增强子在细胞命运决定过程中的作用;

    4.表观遗传相关人类疾病的基因调控机理。



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