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2020跨年盘点丨MG娱乐网站网址三维基因组闯关之路

发布时间:2020-1-2 9:00:20阅读次数: 分享到:

        2019年即将成为过去,回顾这整一年,相信大家都有很多的收获,如果将一年设置为12个关卡,要想成为通关玩家,那么每个月都需要做出一些成绩来获得“通关卡”,下面是MG娱乐网站网址三维基因组的闯关之路,而对于个人而言,大家这一年又是如何闯关的呢?


2月

项目文章-条石鲷鱼染色体水平基因组发表GigaScience

        中国科学院海洋研究所联合MG娱乐网站网址采用PacBio+Hi-C技术获得了条石雕鱼染色体水平参考基因组,文章于2019年2月以题为“Genome sequence of the barred knifejaw Oplegnathus fasciatus (Temminck & Schlegel, 1844): the first chromosome-level draft genome in the family Oplegnathidae”发表在GigaScience。


        组装基因组大小768.8 Mb,contig N50= 2.1 Mb,scaffold N50=33.5 Mb,长度大于100 kb的contigs挂载率达到99.7%。该基因组的组装有助于研究鱼类性别决定机制,丰富抗性育种系统中的基因组资源。


3月

举办首届“三维基因组学在物种进化研究中的应用”研讨会

        MG娱乐网站网址于2019年3月15日举办了首届“三维基因组学在物种进化研究中的应用”研讨会,会上邀请了基因组进化领域的大牛莅临现场作学术报告和交流探讨,推动了三维基因组学在物种进化领域的应用研究。


        莅临研讨会的领导和专家学者有:钱德平(生物办常务副主任)、王文教授(西北工业大学)、周晓农所长、张仪研究员、刘琴研究员(中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所)、胡薇教授(复旦大学生命科学学院)、何舜平研究员(中国科学院水生生物研究所)、陈楠生教授(mg平台注册送38元体验金首席科学家)。


4月

MG娱乐网站网址三维基因组VIP周末培训班第四期开班

        MG娱乐网站网址三维基因组VIP周末培训班第四期于4月6日至7日如期举行,继续为大家带来三维基因组领域的经典理论知识、常用分析工具及生信上机操作经验。讲师、助教与学员们充分交流,VIP服务,学员收获满满。



5月

三维基因组学免费线上课程通道开启

        MG娱乐网站网址三维基因组团队本着推广三维基因组的宗旨,在三代和三维基因组学技术交流群中发起了“MG娱乐网站网址三维基因组学线上课程分享”,活动为期2个月,每周二晚8点如期进行,为群里的几百位学员详细讲解三维基因组技术的原理和应用。



6月

项目文章-西藏高原鳅染色体水平基因组发表Molecular Ecology Resources

        华中农业大学水产学院杨瑞斌副教授联合西藏农牧科学院水产所、MG娱乐网站网址等项目组成员,采用PacBio+Hi-C技术,对西藏高原鳅的染色体水平基因组图谱进行绘制,组装得到了625Mb的基因组,contig N50长度2.9Mb,Hi-C挂载到25条染色体,挂载率高达98.7%,为鱼类的高原极端环境适应性研究提供了新平台,文章以题为“The chromosome-level genome assembly of Triplophysa tibetana, a fish adapted to the harsh high-altitude environment of the Tibetan plateau”发表在Molecular Ecology Resources。



6月

突破!MG娱乐网站网址低细胞量Hi-C强势来袭!

        MG娱乐网站网址紧跟技术发展趋势及结合市场需求,成功开发了低起始量的Hi-C建库方法,5千个细胞即可成功建库!使用相同的材料,以不同的起始量分别进行Hi-C建库测试,结果发现小数据量质控结果均合格且数据的重现性非常好,有效数据率均达到60%左右。



7月

再次突破!MG娱乐网站网址低起始量Hi-C建库降至200个细胞!

        MG娱乐网站网址继续降低Hi-C建库门槛,分别对2万、2千、2百个细胞的起始量进行Hi-C建库,并进行小数据量测序评估文库质量,数据质控结果显示,三个文库均合格,有效数据率最高达67%,而200个细胞起始量的Hi-C文库有效数据率也达到48%。



7月

Hi-C数据可视化浏览器正式上线

        三维基因组浏览器可以在全基因组范围更加直观地展示三维组学数据,可以结合其它组学数据进行多组学联合展示,从目标区域可视化结果中挖掘有效信息。


        MG娱乐网站网址三维基因组团队结合客户需求,基于WashU EpiGenome Browser,搭建了Frasergen Hi-C Studio可视化平台,用于多组学数据实时可视化查询,便于客户进一步挖掘隐藏在数据背后的生物学意义。整个检索界面相当便捷友好,选定物种和参考基因组后,可通过基因、SNP或基因组位置进行检索,主要支持Hi-C、ATAC-seq、ChIP-seq和RNA-seq数据类型的展示。


7月

项目文章-棘头梅童鱼染色体水平基因组发表Scientific Data

        集美大学与MG娱乐网站网址合作,采用PacBio+Hi-C技术获得了棘头梅童鱼染色体水平参考基因组,contig N50为1.1Mb,scaffold N50为35.9Mb,Hi-C挂载率达96.86%,高质量的参考基因组为硬骨鱼类的性别决定机制、性染色体进化等研究提供了新见解。文章以题为“Chromosome assembly of Collichthys lucidus, a fish of Sciaenidae with a multiple sex chromosome system”发表在Scientific Data。



8月

CUT&Tag新品上市

        为克服ChIP-seq技术中的细胞起始量大、背景噪音较高等难题,MG娱乐网站网址基于美国Fred Hutchinson癌症研究中心Steven Henikoff团队开发的CUT&Tag技术,经过研发摸索,成功推出面向市场的CUT&Tag科研技术服务,助您获得高信噪比和“高颜值”的peaks。目前该产品正在火热销售中。



8月

项目文章-红带锥蝽染色体水平基因组发表GigaScience

        中国疾病预防控制中心寄生虫病研究所与MG娱乐网站网址合作,采用PacBio+Hi-C技术获得红带锥蝽的染色体水平参考基因组,组装基因组大小680.73Mb,contig N50=2.72Mb,scaffold N50=50.70Mb,Hi-C将contigs挂载到13条染色体上,挂载率92.51%,红带锥蝽染色体水平参考基因组能为南美锥虫病的发病机制研究提供新见解。文章以题为“A chromosomal-level genome assembly for the insect vector for Chagas disease, Triatoma rubrofasciata”发表在GigaScience。




9月

MG娱乐网站网址Hi-C试剂盒上市,国内首家!

        MG娱乐网站网址基于多年来Hi-C实验经验的积累,特推出专一适用于动物样本的Frasergen Hi-C试剂盒,尚属国内首家!该Kit涵盖了Hi-C实验全部环节,包括样本的甲醛交联,Hi-C文库构建和二代测序文库构建,适用于细胞系、脊椎和非脊椎动物组织样本和血液,试剂盒内附详细的操作手册说明书,步骤简单易懂,试剂盒价格可观,欢迎订购。



10月

举办MG娱乐网站网址国际三维基因组学研讨会青年学者培训沙龙

        MG娱乐网站网址国际三维基因组学研讨会青年学者培训沙龙于10月10日在清华大学医学院隆重举办。此次沙龙邀请了中国人民解放军军事医学科学院赵志虎研究员、清华大学清华信息科学与技术国家实验室高军涛副研究员、陈阳助理研究员,《Nature Methods》高级编辑唐麟老师等行业内知名专家作为主讲嘉宾,活动吸引了来自清华大学、北京大学、中科院基因组所、遗传所、动物所、南海所、中国农业科学院、中国人民解放军军事医学科学院、公安部物证鉴定中心、中国农业大学、华中农业大学等百余位青年学者参加。专家学者分享了自己研究过程中的思路、发现及最新进展,并和学员就三维基因组学领域的发展和技术突破等话题进行了深入探讨。



10月

项目文章-褐云玛瑙螺染色体水平基因组发表GigaScience

        中国疾病预防控制中心寄生虫病研究所与MG娱乐网站网址合作,采用PacBio+Hi-C技术获得了褐云玛瑙螺的染色体水平参考基因组,组装基因组大小1.85Gb,contig N50=721.0 kb,scaffold N50=59.59Mb,Hi-C将contigs挂载到31条染色体上,挂载率高达99.32%,为褐云玛瑙螺的环境适应性及软体动物染色体进化和入侵防治提供了参考依据。文章以题为“A chromosomal-level genome assembly for the giant African snail Achatina fulica”发表在GigaScience。




11月

项目文章-拟鲶高原鳅染色体水平基因组发表Frontiers in Genetics

        中科院水生生物研究所与MG娱乐网站网址合作项目-拟鲶高原鳅基因组以题为“A Chromosome-Scale Reference Assembly of a Tibetan Loach, Triplophysa siluroides”发表在Frontiers in Genetics期刊上。MG娱乐网站网址采用Hi-C技术将拟鲶高原鳅基因组contigs组装到染色体水平,共挂载到25条染色体上,挂载率达到99.13%,可为高原鳅的环境适应性和进化研究提供新见解。




12月

MG娱乐网站网址三维基因组强化培训班第一期开班

        MG娱乐网站网址于12月28~30日举办了三维基因组强化培训班,此次“强化班”与之前的“VIP周末培训班”相比,增加了培训内容和时长,但费用不变,可谓“加量不加价”。三十多名学员在2020年跨年之际与MG娱乐网站网址的各位讲师和助教们度过了愉快的学习时光,满载而归~



        回顾2019年,MG娱乐网站网址三维基因组收获许多,三维团队通过不断升级优化和开发新老产品,以全身心的投入赢得了越来越多老师和同学们的亲睐,看到客户们纷纷“路转粉,粉转铁”,“口碑票款”双双飙升,我们深感欣慰,努力终有回报。感谢每一位支持我们、关注我们的客户,也感谢MG娱乐网站网址每一位同事的辛勤付出,我们继续加油。


        2020年,祝大家科研更顺利,祝mg注册就送58能有更好的成绩~


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