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重磅 | mg注册就送58合作发起万种鱼基因组计划(Fish10K)正式发布

发布时间:2019-9-23 15:08:38阅读次数: 分享到:


        With more than 30,000 species, fish is the largest and most ancient group in vertebrates, which also plays important roles in ecosystem and human society. The advancement of sequencing technologies and algorithms utilizing new sequencing data makes sequencing large number of fish genomes feasible.


         万种鱼基因组计划,简称Fish10K(Fish 10,000 Genomes Project)于9月21日在“2019年国际海洋基因组会议(ICG-Ocean 2019)”上正式对外发布,Fish10K由中国科学院水生生物研究所联合西北工业大学、中国科学院海洋研究所、UPPSALA UNIVERSITET、青岛华大基因研究院及MG娱乐网站网址共同发起,旨在绘制万种代表性鱼类基因组图谱,涵盖世界各地鱼类的所有目和代表性科,建立一个大规模,高质量的鱼类基因组数据库,聚焦鱼类基因组研究。


        Fish10K计划将通过10年的时间,以开放的国际联盟运行形式,致力于推进10,000种鱼类基因组的研究,进一步加速生物学界对生物多样性的研究及鱼类资源的利用和开发,自发布之日开始,招募系列研究项目作为子项目,并欢迎全球的合作伙伴加入,以期共同探讨解决理论研究和应用科学的主要问题。



MG娱乐网站网址生信总监Jeff参会ICG-Ocean2019并联合发布Fish10K计划


        目前,Fish10K计划已经正式启动,计划利用最新的三代长片段测序技术、辅以Hi-C手段,构建目级别鱼类染色体水平参考基因组。项目首席科学家中国科学院水生生物研究所何舜平研究员表示,“利用Fish10K计划建立的鱼类基因组数据库拟解决鱼类的一系列生物学问题,包括鱼类的系统发育、起源与大陆板块漂移事件;鱼类基因组复制、基因组大小与染色体进化的关系; 极端环境鱼类适应性进化;鱼类体型及特殊器官发育形成;重要进化节点鱼类基因组染色体构象与进化等重要科学问题。”

        MG娱乐网站网址深耕水产基因组研究领域多年,拥有丰富的鱼类基因组及3D基因组项目经验,作为Fish10K计划合作发起单位之一,MG娱乐网站网址将利用国内率先引进的PacBio Sequel II测序平台和Hi-C技术,对计划中若干种重要鱼类的基因组进行高质量测序,构建鱼类染色体水平参考基因组、绘制进化节点鱼类基因组3D构象,全方位解析鱼类起源与进化关系,为建立一个大规模、高质量并具有一定应用前景的鱼类基因组大数据库贡献自己的一份力量。



相关研究计划

        2014年--鸟类基因组计划(B10K):旨在从所有现存的鸟类中产生代表性的原始基因组序列。

        2017年--脊椎动物基因组计划(VGP):旨在为所有66,000种现存脊椎动物物种生成无误差的参考基因组组装。

        2017年--地球生物基因组计划(EBP):旨在对地球上所有真核生物多样性的基因组进行测序,编目和表征。


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